一个革命性的免费软件平台,助力您的计算化学研究。
PsiStack通过将各种强大的软件集成到一个用户友好的平台上,彻底改变了计算化学软件的管理。让复杂且耗时的安装和部署过程现在变得轻而易举。
PsiStack支持Amber, Gromacs, OpenMM, PsiCode, XTB, Plumed, PySCF等计算化学软件在多种操作系统上的快速安装和部署,免去逐一编译安装的烦恼,并简化软件更新和维护。
将您的研究提升到新的高度
在计算化学中管理各种软件包及其复杂的相互依赖关系(如GCC和FFTW)是一件极其繁琐的工作。此外,跟踪科学软件的更新(这些软件通常有特定的版本要求)也非常耗费精力,并可能分散您的核心研究目标。PsiStack通过为您处理软件依赖性和更新,减轻了这些负担。
PsiStack兼容运行CentOS、Rocky、Ubuntu及类似操作系统的工作站、服务器和集群。目前,它支持广泛的流行工具,包括Amber、Gromacs、NAMD、OpenMM、LAMMPS、PLUMED、Autodock、PSI4、xTB、PySCF、CP2K、Quantum Espresso等。SP团队致力于不断扩展PsiStack的功能,引入更多的软件包和支持,让您可以专注于真正重要的事情——您的研究。
PsiStack通过以下优势,帮助计算化学家专注于研究,轻松驾驭创新的未来
一站式工具平台
整合从量子力学到分子动力学的多样化开源软件,包括流行的工具和框架,所有都在 PsiStack仓库中
迅捷的安装部署
以最少的设置快速配置您的工作站、服务器或集群,无缝加载PsiStack存储库
持续自动更新软件
定期引入领域内新软件并确保现有软件更新至最新版本,降低运维成本
安全可靠的数据传输
通过单向HTTP连接规避防火墙限制,确保本地数据存储的安全性
高效的按需加载
通过按需加载优化本地资源使用,满足精确需求
动态多版本支持
适应同一软件的多版本,满足当前版本和旧版本不同需求
如何安装
通过在终端中运行以下内容来设置 PsiStack 的客户端:
$ curl -s https://stack.singleparticle.cloud/PsiStack-install.sh | sudo sh
安装后,请先登出,然后重新登录您的计算机。运行命令列出所有可用软件。
有关安装过程的更多详细信息,您可以参考视频指南。
软件使用说明
列出所有软件
$ module avail
OpenMM
$ module load OpenMM/8.0.0-foss-2022a-CUDA-11.8.0
PySCF
$ module load PySCF/2.1.1-foss-2022a
PSI4
$ module load PSI4/1.7-foss-2022a
AmberTools
$ module load AmberTools/22.3-foss-2022a
GROMACS
$ module load GROMACS/2023.1-foss-2022a-CUDA-11.8.0
PLUMED
$ module load PLUMED/2.8.1-foss-2022a