文末领福利|上海精准医学研究院-第一届电镜论坛暨暑期培训班精彩回顾!

2024年7月13-19日,由上海精准医学研究院冷冻电镜中心联合上海电子显微学学会和苏州德锐特举办的“上海精准医学研究院-第一届电镜论坛暨暑期培训班”在上海成功拉下帷幕。论坛聚焦电镜技术在生物大分子结构和功能上的应用,旨在促进电镜技术更广泛的应用到科研当中,更好服务于新药研发。同时,开办的专业培训班从技术层面突破,为电镜领域的人才储备提供扎实的基础知识和技能。

集体合影

7月14日上午,本次论坛会议主席上海精准医学研究院黄晶研究员做开幕致辞,大会荣誉主席上海市显微学学会秘书长杨勇骥研究员也对此次论坛表达了寄语。各位专家围绕自身研究方向,着重介绍了发展多种基于电镜开发的新技术手段,同时结合多个典型案例深入浅出地阐述了利用多种高端电镜技术解决科学问题的各种方案。

作为本次论坛会议的协办单位,德锐特立足于推动先进冷冻电镜技术的发展,专注于冷冻电镜计算软硬件的研发和应用,截止目前,公司已累计与全球超300家客户建立业务联系,公司不断优化客户体验,已形成以冷冻电镜技术、计算化学以及CMOS探测器相结合的综合性品牌服务商,通过十多年的经验积累,公司已在国际市场建立起强大的品牌信任度和影响力。

7月15日-19日,来自高校、科研院所和企业的精英代表参加了本次暑期培训班,德锐特公司的培训导师李腾腾、张雯和李鹏飞老师分别针对Linux系统,单颗粒数据解析,tomo数据解析和动力学模拟分析等方向的技术做了详细的知识分享,并有针对性的为学员提供实操演练,让学员们在这5天的培训中收货满满。

▲培训班合影

课程教学大纲

课程名称:单颗粒数据解析

课程类型:软件技术

适用对象:结构生物学冷冻电镜技术研究

RELION

  1. 冷冻电镜基本原理
  2. 三维重构相关概念
  3. RELION使用说明
  4. RELION数据解析流程

ChimeraX

  1. UCSF与ChimeraX
  2. ChimeraX界面介绍
  3. 使用ChimeraX对比密度图
  4. 使用ChimeraX制作Mask
  5. 使用ChimeraX拟合分子模型
  6. 使用ChimeraX查看密度图局部分辨率

课程名称:动力学模拟分析

课程类型:软件技术

适用对象:结构生物学冷冻电镜技术研究

  1. 生物分子动力学模拟简介
  2. Amber22和AmberTool23软件安装
  3. Amber分子动力学模拟前PDB文件处理注意事项
  4. Amber软件工具中的Anthchamber模块的使用说明
  5. Amber力场参数文件格式介绍
  6. Amber软件工具中LeaP模块的介绍和使用
  7. Amber分子动力学模拟输入输出文件内容参数介绍
  8. Amber分子动力学模拟-人工多肽分子SINGLEPARTICLE
  9. Amber 分子动力学模拟-SP4206分子结合IL2靶点蛋白过程模拟
  10. Amber软件工具中的cpptraj和mdout_analyzer模块的使用说明
  11. 使用cpptraj工具进行PCA分析
  12. Amber分子动力学模拟-核酸分子体系DNAzyme体系的模拟
  13. Amber分子动力学模拟-膜蛋白体系模拟
▲培训班现场

此次论坛为行业内的科研与技术人员提供了最前沿的电镜技术学习与交流平台,共同探讨电镜未来关键核心技术突破,促进了多学科的交叉融合。

注册“cryoEDU平台” 持续提升学习效率

▲cryoEDU学习平台界面

为进一步强化学员在培训期间学到的知识,德锐特冷冻电镜计算部特推出”cryoEDU应用软件学习平台“。目前,该学习平台已正式上线!!只需99元/天,注册成功后,便可以在任意电脑上远程学习分子动力学模拟相关软件:Amber 22, AmberTools 23, PyMOL(Open Source),冷冻电镜数据处理软件:Relion。学员们可以通过云桌面远程访问数据中心级别的计算资源,强大而稳定的软件环境亦能让学员们体验到真实的分子动力学模拟分析过程和冷冻电镜数据解析过程。

如需了解详情,请拨打服务热线151-514-59168(胡经理)或扫描下方二维码。

观看“免费公开课” 获取深度好知识

虽然这期线下培训已结束,但我们的知识仍在持续输出,为了让学员们获取更多知识,德锐特推出了15节Amber分子动力学模拟基础课程的公益视频课,为了方便大家观看,我们的15节公益视频课已发布到各大平台,公众号上回复“分子动力学”,我们将免费提供观看链接和方式,感谢大家的关注。

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