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冷冻电镜软件更新

随着Falcon 4的推出，支持EER格式成为各解析软件需要满足的一个重要功能，我司为大家整理了一些主流软件的更新。

近日，主要的冷冻电镜软件公司纷纷更新并发布新版本。Relion，cryoSPARC，EMAN2都发布了稳定版更新。

经过我们的测试，这些版本都适合进行安装和更新，欢迎大家联系我们获取更多软件安装和更新服务的细则。

01-Relion 3.1.2更新

Relion在前一个版本3.1.1中，提供了对Falcon 4 EER格式的支持，并进行了一些优化。

而在新的3.1.2小版本更新中，值得一提的是支持了对AMD专门优化的FFTW库，小编认为，此次更新针对AMD CPU的机器相对之前的版本在relion的运算中会有更好的表现。

另外，Relion采用的FFTW版本的提升也使得Relion在Ubuntu20等新系统下的安装更加顺畅。

相关链接：https://github.com/3dem/relion/releases/tag/3.1.2

02–cryoSPARC 3.2更新

cryoSPARC去年年底进行了3.0大版本更新，增加了大量功能： 

  • 进一步提升了Non-Uniform Refinement功能
  • 可支持CUDA 11（解决了cryoSPARC与NVIDIA新一代显卡3090的兼容问题）
  • 可支持Falcon 4的EER格式数据，将cryoSPARC live开放给了所有用户，修复了旧版本的很多bug。

 3.0版本因更新较多，存在一些不稳定的问题，在用户的反映下，cryoSPARC官方进行了大量的性能优化工作和错误修复，近日又推出了更加稳定的3.2版本。

cryoSPARC 3.2更新：

  • 增加Project和Workspace根据时间或字母顺序排序的功能
  • 显著提升2D、Refinement等任务在存储上读写的速度，解决cryoSPARC在3.1上比2.15更慢的问题
  • 进一步优化了GPU应用
  • 修复了CentOS7上的cuMemHostAlloc failed问题
  • 修复了Patch CTF Estimation的Index Error和Value Error问题

强烈推荐用户更新到最新的3.2版本；还未安装使用cryoSPARC的用户，也可通过cryoSPARC官方网站，申请license进行试用。
相关链接：https://cryosparc.com/updates

03–EMAN 2.91更新

EMAN2更新了2.9版本，随后在2.91版本中修复了上次更新产生的bug。建议直接更新到稳定的2.91版本。
功能上，EMAN2在in situ tomo处理做了很大的改进，同时也加强了深度学习在EMAN2中的应用，包括在挑颗粒中原本包含的应用，以及在tomo中挑颗粒的新添加应用，也包括在3D模型可变性中的应用。
性能上，最新的数据压缩格式占用空间更小，加载更快，传输更方便，也在一定程度上加快了运算速度。同时，还支持Falcon 4的最新EER格式和oversampling功能，代码也升级到了Python3。
相关链接：https://cryoem.bcm.edu/cryoem/downloads/view_eman2_version/32

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